Neu in Prince of Persia The Two Thrones ist das Speed-Kill-System. Es ermöglicht eine Attacke auszuführen, die den Gegner sofort und ohne Gegenwehr tötet. Der Prinz sowie der Dunkle Prinz führen unterschiedliche Speedkills durch. Während der Prinz den Dolch der Zeit benutzt, wird die Klingenkette beim Dunklen Prinzen eingesetzt. Je nach Gegner sind mehrere Schläge nötig, um ihn zu töten. Näheres dazu in der Kategorie "Gegner".
Um Speedkills auszuführen müssen mehrere Faktoren passen:
Zu einem darf der Gegner den Prinzen noch nicht bemerkt haben. Sie können den Prinzen durch sehen, oder hören ausfindig machen. Wenn der Gegner den Prinzen entdeckt, geht es automatisch in das Free-Form-Fighting-System über.
Sobald der Prinz hinter, über, oder in der Nähe der Gegner ist, pocht das Bild. Nun kann man den Speedkill mit einem Druck auf "Sekundärer Angriff" starten. Der Prinz springt auf den Gegner und der Dolch leuchtet. Jetzt folgt eine Geschicklichkeitsphase, in der man immer zur richtigen Zeit die Angriffstaste drücken muss. Sobald der Dolch leuchtet drückt man "Angriff" und der Prinz führt den Angriff aus. Das wiederholt sich solange, bis der Feind tod ist.
Zu manchen Situationen ist es auch möglich doppelte Speedkills durchzuführen. Wenn z.b. 2 Gegner voreinander stehen, mit dem Rücken zu dem Prinzen, führt der Protagonist ein doppelten Speedkill aus und tötet beide Gegner.
Um Speedkills mit dem Dunklen Prinzen auszuführen, muss er, genauso wie der Prinz, unentdeckt hinter dem Feind sein. Auch hier pocht das Bild sobald ein Speedkill möglich ist. Nun kann man den Speedkill mit dem Druck auf "Sekundärer Angriff" starten. Der Dunkle Prinz wirft seine Klingenkette über den Gegner, an seinen Hals. Jetzt muss wiederholt, so schnell wie möglich, die Taste "Sekundärer Angriff" gedrückt werden bis der Gegner tot ist.
An Stellen, wo der Dunkle Prinz an einer Kette über dem Gegner hängt, muss nur der Speedkill aktiviert werden und der Feind ist tot.
Die Zwischengegner werden auch alle mit Speedkills getötet, jeder benötigt aber seine eigene Taktik. Auch hier gilt, der Speedkill wird mit der Taste "Sekundärangriff" gestartet, nur muss sich der Prinz nicht an den Endgegner/Zwischengegner anschleichen, sondern kann ihn an bestimmten Punkten aktivieren.